Araştırmacıların yeni koronavirüs de dahil olmak üzere bazı tıbbi problemlerle başa çıkmalarına yardımcı olmak için bilgisayarda çalıştırılabilen popüler bir uygulama olan Folding @ home'u duymuş olabilirsiniz.
Geçen ay, onu kuran gönüllüler ağı o kadar genişledi ki, platform dünyanın en güçlü süper bilgisayarlarını geride bıraktı.
Folding @ home yöneticisi ve biyokimyacı Greg Bowman'a göre, geçtiğimiz haftalarda yaklaşık 700.000 yeni Folding @ home operatörü katıldı. Bu, Folding @ home'u her zaman rutin olarak kullanan 30.000 kişiden büyük bir artış.
Ayrıca, bilgi işlem gücünde büyük bir fark yaratıyor – Folding @ home ağı, bu haftanın başlarında inanılmaz bir 2,4 exaflop bilgi işlem gücüne ulaştı ve bu, onu dünyanın en iyi 500 süper bilgisayarının toplamından daha hızlı hale getirdi.
Folding @ home'un ana görevi, birçok temel biyolojik işlevin altında yatan proteinlerin vücutta nasıl davrandığını modellemektir.
Bu işlevler viral enfeksiyonu içerir: Folding @ home ekibi, özellikle SARS-CoV-2 virüsünün (aslında üç proteinden oluşan) 'sivri uçlarının' insan hücrelerine nasıl bağlandığını ve insan vücudunu nasıl enfekte ettiğini inceliyor.
Bu, yeni koronavirüsün insan dokusuna girmesinin önemli bir yoludur, bu nedenle engellenmesi gelecekteki tedaviler ve aşılar için kritik olabilir. Spike proteinlerinin nasıl çalıştığını anlayabilirsek – bu, Folding @ home'un bilgisayar simülasyonlarının yaptığı şeydir – onları durdurmak için daha iyi ilaçlar geliştirebiliriz.
SARS-CoV-2 proteininin hareket halindeki artışı. (Katlama @ home / YouTube)
Bowman, Folding @ home blogunda “Ev bilgisayarınızda böyle bir işlemi simüle etmeye çalışırsanız, önümüzdeki 100 yıl boyunca sürecin bir bölümünü bile görebilecek kadar şanslı olursunuz” diye yazıyor. “Neyse ki, takviye kuvvetimiz var!”
Folding @ home'un büyüsü, protein davranışının karmaşık bilgisayar simülasyonlarını daha küçük görevlere böldüğü ve daha sonra dünyanın dört bir yanındaki binlerce bilgisayara dağıtılabildiği – her biri bir parça alıyor.
Folding @ home ayrıca koronavirüsle ilgili birçok başka proje yürütüyor: şu anda laboratuvarlarda test edilmekte olan potansiyel ilaçların etkinliğini değerlendirmek ve koronavirüsün enfeksiyondan sonra hücre mekanizmasını nasıl kontrol ettiğini analiz etmek için verileri işliyor.
