Araştırmacılar, SARS-CoV-2 koronavirüsün genetik kodunda, virüsün genomunda neredeyse görünmeyen ve hala gözden kaçan bir bölüm olan gizemli bir gen keşfettiler.
Yeni tanımlanan gen – ORF3d – örtüşen gen denen şeyin bir örneğidir: diğer genlerin kodlanmış dizileriyle örtüştüğü için nükleotid zincirinde etkili bir şekilde gizlenen bir tür 'gen içindeki gen'.
American Museum of Natural History'den biyoinformatist Chase Nelson, “Genom boyutu açısından SARS-CoV-2 ve akrabaları var olan en uzun RNA virüsleri arasındadır” diye açıklıyor.
“Bu nedenle, diğer RNA virüslerinden daha 'genomik hileye' daha duyarlıdırlar.”
Aslında, virüsler örtüşen genlere sahip olma eğilimindedir, bu nedenle bu tam olarak şaşırtıcı bir keşif değildir. ORF3d'nin gerçekten genomik bir aldatmaca olup olmadığı görülmeye devam ediyor, ancak yine de görmek kesinlikle zor.
Örtüşen genlerin genetik dizilerde tanımlanması zordur çünkü genomik tarama sistemleri, genetik kod satırlarını tararken genellikle bunları atlayabilir: tek tek genleri seçmek için programlanırlar, ancak dizideki bitişik genlerin nükleotidlerinde ortak olan kapsayıcı talimatları mutlaka görmezler.
SARS-CoV-2 virüs parçacıklarının elektron mikrografı. (NIAID).
SARS-CoV-2 gibi virüsler bağlamında, bu ciddi bir kör nokta oluşturabilir. Bilim adamları, bu yıkıcı virüsü bu yılın başından beri olabildiğince anlamaya çalışıyorlar ve genetik yapısının bazı yönleri açıklanmış olsa da ('laboratuvarda yaratılmadığına dair kesin inanç dahil'), henüz bilmediğimiz çok şey var. .
“Örtüşen genler, koronavirüslerin verimli bir şekilde çoğalmak, konakçı bağışıklığını zayıflatmak veya kendilerini iletmek için evrimleştiği yollardan biri olabilir.”
ORF3d'ye gelince, neden var olduğu, genomda gizlendiği ve diğer genlerle örtüştüğü hakkında öğrenilecek çok şey var.
COVID-19 hastalarının önceki kan testlerine dayanan gizemli gen hakkında kesin olarak bildiğimiz bir şey, ORF3d'nin güçlü bir antikor tepkisini tetiklediğidir.
Nelson, “Henüz işlevini ve klinik önemini bilmiyoruz” diyor.
Ancak, bu genin, bir antikor tepkisinin aksine, bir T hücresi tepkisi ile tespit edilme olasılığının nispeten düşük olduğunu tahmin ediyoruz. Ve belki de genin nasıl ortaya çıkabildiğiyle bir ilgisi vardır. '
Bir şey kesin. Sadece 15 kadar bilinen gene sahip bir virüs için, üst üste binen bir genden bahsetmiyorum bile bir başkasının keşfi önemli bir ilerlemedir. Bilim adamları şimdi ne kadar önemli olduğunu bulmaya çalışacak.
Sonuçlar eLife'a bildirilir.
